Passionné par la vie, Jacques Malaterre a été éducateur pour l’enfance inadaptée pendant plus de douze ans et chargé de cours à l’Université de Provence. En 1989, il devient réalisateur. D’abord documentariste, ses films lui permettent de poursuivre son exploration du monde et des gens. Il approche ainsi le domaine de l’art en filmant Zingaro, Maria Casarès, Béjart, Pina Bausch… mais aussi celui de la littérature en réalisant les portraits de JMG Le Clésio, René Char, Pascal Quignard… Il n’en oublie pas pour autant la société et l’histoire avec le week-end des français, les supporters de l’OM ou la Libération de 1944… Sa soif de connaître et son bonheur à découvrir le conduisent aussi au bout du monde avec des films sur les pêcheurs à la loutre au Viêt-Nam, les Tsaatans en Mongolie ou encore les hippopotames en Ouganda…

En 1996, il se met à travailler pour la fiction tout en gardant la passion des personnages qu’il a approfondie dans le documentaire. Il crée ainsi plusieurs séries télévisées comme Boulevard du Palais, Commissariat Bastille, SOS 18, ou réalise différents téléfilms tels que L’Amour Interdit, Fibre mortelle… TF1, France 2, France 3, Arte, M6 ou Canal + sont alors ses terrains d’expression.

Ce savoir faire, cette farouche envie de se remettre en question à chaque film qu’il considère toujours comme une nouvelle aventure humaine, le conduiront à réaliser, en 2001, après plus de deux ans de travail, L’Odyssée de l’Espèce, extraordinaire succès télévisuel dans le monde.

Après avoir gagné la mise en scène de théâtre avec La vie sexuelle de Catherine M  et Agatha de Marguerite Duras, Jacques Malaterre renouera avec le documentaire-fiction. À travers deux films, il raconte la préhistoire de nos ancêtres avec Homo Sapiens, et la naissance des civilisations avec Le Sacre de l’Homme. Ces deux réalisations ont rencontré le même succès international que la précédente. De plus, entre 2005 et 2006, il est président de la commission du COSIP pour le CNC.

En 2008, il tourne un film historique sur L’Assassinat d’Henri IV avant de réaliser en 2009, après six ans de travail, son premier long métrage de fiction AO le dernier Neandertal, sorti en salles le 29 septembre 2010, année où il met en scène pour France Télévisions une adaptation de la nouvelle de Prosper Mérimée Carmen. Il adapte également, en bande dessinée, L’Odyssée d’Ernest Shackleton (Sur les bords du monde  Tome 1 – sorti en juin 2012 / Sur les bords du monde Tome 2 – sortie prévue pour février 2014).

En 2011, il développe pour les Etats-Unis et le marché européen une série de fictions historiques en 12 épisodes : Vercingétorix, l’homme qui a dit non à Jules César et tourne pour France 3 un grand reportage Les Calanques, Secrets et Merveilles.

En juillet de la même année, Jacques Malaterre est élevé au grade de Chevalier de la légion d’honneur.

La même année, il co-écrit pour le cinéma une adaptation de l’œuvre de Henri Bosco L’enfant et la rivière et une comédie sentimentale Une nuit à Rome inspirée de la bande dessinée éponyme.

En 2012, il reçoit le prix Marianne pour l’ensemble de sa carrière. En 2013, pour France 2, il réalise sans le signer, un grand documentaire nature Le plus beau pays du monde. Dans le même temps, il crée et réalise le pilote d’une nouvelle série pour France 5 Ceux du bout du monde.

Pour 2014, il prépare une série documentaire pour Arte À l’ombre de l’Histoire (20 x 26’) et un téléfilm pour France 2 Max et la rumeur.